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3-羟基己酸甲酯为羟基脂肪酸低级烷基酯，是组成聚羟基脂肪酸酯的单体之一，可作为燃料使用。聚羟基脂肪酸酯(Polyhydroxyalkanoates，PHA)是微生物在生长不平衡的环境下积累的能源和碳源贮藏物。组成PHA的单体多种多样，截至目前，已发现组成PHA的单体有100多种。
以微生物合成的PHA作为来源的各种羟基脂肪酸低级烷基酯作为燃料可以丰富目前的生物燃料领域，同时具有良好的社会和经济效益。这些羟基脂肪酸低级烷基酯(例如甲酯或乙酯)作为燃料具有合适的燃烧热、零污染物排放、可以和通用燃料例如汽油等混合使用、同时可以改善汽油等燃料的燃烧、提高其辛烷值等效果。作为燃料使用的羟基脂肪酸低级烷基酯具体包括但不限于3-羟基丁酸甲酯、4-羟基丁酸甲酯、3-羟基丁酸乙酯、3-羟基丁酸甲酯或乙酯和3-羟基戊酸甲酯或乙酯的各种摩尔比例的混合物、3-羟基丁酸甲酯或乙酯和3-羟基己酸甲酯或乙酯的各种摩尔比例的混合物、3-羟基中长链脂肪酸甲酯或乙酯的混合物、3-羟基丁酸甲酯或乙酯和4-羟基丁酸甲酯或乙酯的各种摩尔比例的混合物、3-羟基丙酸甲酯或乙酯、2-羟基丙酸甲酯或乙酯等。
此外，3-羟基丁酸及其衍生物如3-羟基己酸甲酯容易被人体吸收，安全剂量高，没有显著的毒副作用，可以有效抵抗肠道慢性的炎症，非常合适作为慢性炎症导致的癌症患者作为长期服用的辅助性药物。
[1]CN200810098735.7羟基脂肪酸衍生物作为燃料添加剂的应用
[2]CN201910160165.83-羟基丁酸及其衍生物在制备防治结肠炎、结肠癌的产品中的应用