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木瓜蛋白酶广泛存在于双子叶植物番木瓜的根、茎、叶和果实中，其中以未成熟果实的果汁中含量最为丰富，约占干重的40%。
木瓜蛋白酶（papain）,又称木瓜酶，是一种羟基蛋白水解酶。分子量为23406，CAS号为9001-73-4。木瓜蛋白酶很容易失活，一些化学物质如氧化剂H2O2或脉冲电场高压等均能使它失去活性，在室温下热稳定性较差。
采用多中心、随机、自身对照的临床试验方法，对110例寻常痤疮患者进行痤疮分级后，给予含木瓜蛋白酶的护肤品，每日2次，连续使用1个月。结果，使用护肤品28天后，皮损有明显改善（P＜0.05）。
木瓜蛋白酶通过抑制活化血小板膜纤维蛋白原受体的表达，并抑制肌动蛋白聚合以及释放反应从而剂量依赖性地抑制血小板聚集反应，有抗血栓形成作用。
食品
在啤酒中加入30μg/ml木瓜蛋白酶可以作为啤酒的澄清剂。木瓜蛋白酶还可以作用肉类加工肉类嫩化，饼干输送剂，以及改良豆类制品等。
保健食品
可应用于各种保健食品。
其他
治疗皮肤溃疡，可以清理痤疮、切断伤、烧烫伤等各种皮肤表面的溃疡，可以有效去除腐烂组织从而防止皮肤感染，而对健康组织无影响。
尚未查到有效资料。
木瓜蛋白酶可引起过敏反应，过敏体质的人群应引起注意。
易受重金属离子和氧化剂破坏。
未查见相关文献资料。
其他 尚未查到有效资料。
木瓜蛋白酶具有抗菌、抗血栓等生理功能及作用，我国批准其为食品添加剂，按生产需要量添加，使用量为0.5~5mg/kg。
本文摘自《营养功能成分应用指南》